121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7806 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 452 aa  915    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  40.05 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  36.43 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  36.08 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.83 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.71 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.67 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.38 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  22.98 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.93 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 464 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  23.51 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.92 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  21.47 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.35 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 487 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.01 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  24.33 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  23.6 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.6 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.51 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.53 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.53 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>