107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5528 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 485 aa  998    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  54.32 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  44 
 
 		 479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  37.7 
 
 		 487 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  38 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 467 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  35.86 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.32 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 472 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  29.27 
 
 		 461 aa  170  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  29.27 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  28.3 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.88 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.04 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  31.3 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 433 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 423 aa  53.5  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.72 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.47 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.87 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  28.06 
 
 		 424 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4955  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.97 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.77 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 433 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.84 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.08 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.43 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  31.54 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.46 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 416 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  21.1 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.92 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>