More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0573 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  92.64 
 
 		 462 aa  865    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 460 aa  930    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  63.3 
 
 		 447 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  46.32 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  34.63 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  33.98 
 
 		 461 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.72 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 467 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.14 
 
 		 485 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.62 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.82 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.53 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.3 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.67 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  36.89 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  26.51 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.96 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  28.8 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  32.46 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.8 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.71 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.71 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.52 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.52 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.58 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.09 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>