More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2551 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 473 aa  933    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  62.17 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  50.53 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  51.64 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  34.72 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.59 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 436 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.36 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.69 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.78 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.21 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.14 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  32.79 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.42 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.02 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  32.31 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  28.9 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.99 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.59 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  32.56 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>