More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1762 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 438 aa  886    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  32.54 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.21 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.62 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.45 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.71 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 440 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.58 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 441 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.74 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.84 
 
 		 450 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.25 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.59 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 454 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.44 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.21 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.6 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 443 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.25 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  34.42 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.53 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.4 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.33 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.48 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.64 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>