225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0829 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 465 aa  937    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  68.68 
 
 		 473 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  69.26 
 
 		 473 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  44.09 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.83 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.33 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.45 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  20.72 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  19.67 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 457 aa  67  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  20.86 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.34 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  18.62 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.79 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  19.94 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  21.26 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.03 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  31.37 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  20.22 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 970 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  19.5 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  19.5 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 406 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 415 aa  53.5  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.43 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 925 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>