83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0548 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0548  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 426 aa  862    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0032157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1074  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00779107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1305  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1306  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.7 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.72 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.64 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1505  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.79 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  21.78 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.49 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0604  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.59 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 470 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.87 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  20.67 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.36 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.56 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.6 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>