78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1543 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1543  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 478 aa  965    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.793818  normal  0.0319696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 467 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.45 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.17 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.32 
 
 		 428 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  22.77 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.29 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.82 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.36 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.11 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  23.06 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.58 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.11 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.56 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  19.94 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.69 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 417 aa  43.5  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.61 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  22.29 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>