More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3941 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 490 aa  985    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  29.78 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.81 
 
 		 366 aa  87  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.27 
 
 		 411 aa  86.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.55 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.62 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.49 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 402 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1543  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.793818  normal  0.0319696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.99 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  20.24 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.34 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.48 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.62 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.94 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  19.77 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.21 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  19.87 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  23.32 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.48 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.82 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 465 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 458 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 427 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.86 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 		 466 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.61 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.51 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  21.3 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>