More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01810 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 415 aa  824    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  52.08 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  34.27 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.84 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0276  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00588273  hitchhiker  0.000015311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  27.4 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.91 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.45 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.67 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.67 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0464  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.39 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.76 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.78 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.92 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.55 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.07 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.59 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.61 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.91 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.91 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.33 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.85 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 464 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  25.08 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.4 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>