82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 552 aa  1128    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  60.19 
 
 		 561 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  50.46 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  47.82 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  39.05 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  42.01 
 
 		 532 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  40.45 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  39.89 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.54 
 
 		 564 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  35.12 
 
 		 565 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  33.52 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  31.85 
 
 		 558 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  29.98 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  28.26 
 
 		 552 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.77 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  28.4 
 
 		 568 aa  144  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.18 
 
 		 544 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  26.28 
 
 		 567 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 561 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 510 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.14 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.25 
 
 		 544 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 567 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  20.61 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 424 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.05 
 
 		 551 aa  53.5  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.73 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 492 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  22.9 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  24.61 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  20.21 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  19.83 
 
 		 553 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 404 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.7 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  41.54 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.5 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  53.66 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1543  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 478 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.793818  normal  0.0319696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 420 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 415 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  22.06 
 
 		 467 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  21.76 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 501 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 		 530 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 450 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 450 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 		 450 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  37.7 
 
 		 504 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 425 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  19.35 
 
 		 482 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 449 aa  44.3  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 424 aa  43.9  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 544 aa  43.5  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>