More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12290 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  100 
 
 
422 aa  832    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  49.53 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  48.14 
 
 
402 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  42.52 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  47.35 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  44.41 
 
 
450 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  44 
 
 
467 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4686  extracellular solute-binding protein family 1  35.81 
 
 
444 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.749978  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  37.94 
 
 
439 aa  237  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  34.27 
 
 
409 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 
432 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 
417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  34.83 
 
 
410 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  34.52 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  36.3 
 
 
412 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  31.56 
 
 
397 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  36.34 
 
 
424 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  35.75 
 
 
413 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
400 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
391 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  34.04 
 
 
392 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  34.04 
 
 
392 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 
391 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 
415 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 
395 aa  193  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  30.82 
 
 
419 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 
398 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 
424 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 
390 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
419 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  30.96 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3696  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 
546 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772784  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
419 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  30.12 
 
 
419 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  30.12 
 
 
419 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  30.12 
 
 
419 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  30.12 
 
 
419 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  30.12 
 
 
419 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  29.88 
 
 
419 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  29.65 
 
 
419 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  29.88 
 
 
419 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
410 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
410 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  32.01 
 
 
408 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  31.65 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
423 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
413 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
423 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 
401 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
411 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  28.38 
 
 
411 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  28.57 
 
 
411 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  31.45 
 
 
395 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
401 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  30.7 
 
 
416 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  30.64 
 
 
392 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
417 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.97 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 
415 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.68 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.41 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.41 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.41 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.41 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.53 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.14 
 
 
396 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.53 
 
 
403 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.53 
 
 
403 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.53 
 
 
403 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.97 
 
 
406 aa  136  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
425 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
400 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
454 aa  123  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
418 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
460 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 
400 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
411 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  26.7 
 
 
410 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
440 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
427 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 
406 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
434 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>