234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1781 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
413 aa  807    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  71.12 
 
 
410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  59.62 
 
 
417 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  57.59 
 
 
415 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  49.27 
 
 
412 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  50.24 
 
 
412 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  46.62 
 
 
439 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
432 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  49.25 
 
 
424 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  44.54 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  36.5 
 
 
467 aa  253  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  37.95 
 
 
402 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  38.18 
 
 
415 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  36.09 
 
 
416 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  36.26 
 
 
422 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  36.17 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  33.07 
 
 
397 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  37.69 
 
 
422 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
391 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
391 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4686  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.749978  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
392 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
392 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  34.66 
 
 
400 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 
400 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  30.52 
 
 
424 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
395 aa  176  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  32.18 
 
 
397 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3696  extracellular solute-binding protein family 1  31.61 
 
 
546 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772784  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
423 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
423 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
393 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
413 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 
400 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  31.56 
 
 
395 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.37 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.69 
 
 
419 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.46 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  25.46 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.46 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  25.46 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.46 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.23 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.46 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.26 
 
 
397 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 
410 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
396 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.33 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.33 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.33 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.2 
 
 
396 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  27.5 
 
 
392 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.83 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  28.24 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.2 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.92 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.92 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.92 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.92 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  26.32 
 
 
411 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  26.32 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
460 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
432 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.88 
 
 
400 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
406 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 
400 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  28.88 
 
 
408 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 
401 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
454 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.76 
 
 
406 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
415 aa  106  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
417 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 
415 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
428 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
418 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
411 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
440 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
449 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.88 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  29.35 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
439 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>