104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2347 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 431 aa  880    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1295  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  29.05 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  21.88 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  27.73 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.78 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  23.94 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  23.94 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.94 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  23.94 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.71 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.71 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  23.49 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.71 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  22.92 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.98 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.98 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.17 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.17 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.33 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  19.76 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  20.44 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  20.25 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.35 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.63 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  20.57 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 418 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.53 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  23.15 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  20.21 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  19.58 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.33 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.89 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.33 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.33 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.03 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  21.11 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.55 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  19.88 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  22.51 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  43.4 
 
 		 569 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.6 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  19.42 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.16 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4686  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.749978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  22.5 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>