More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3595 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  51.34 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  42.42 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  33.85 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  33.06 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  33.93 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  33.52 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  29.72 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.72 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.72 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.79 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 430 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.1 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.62 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12848  sn-glycerol-3-phosphate-binding lipoprotein ugpB  28.21 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0276  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00588273  hitchhiker  0.000015311 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  23.95 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.53 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.57 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.88 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.37 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.56 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>