195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3027 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 467 aa  956    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 449 aa  86.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.11 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.64 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.64 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.08 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  26.72 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  21.05 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.06 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2165  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.29 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.72 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  20.69 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2834  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 432 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.2 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.46 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.46 
 
 		 411 aa  54.3  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0497  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 459 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.128275 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 488 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.13 
 
 		 426 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.13 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1046  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  18.11 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.08 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 514 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0322  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 424 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 487 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 434 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 414 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>