80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2834 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2834  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 452 aa  914    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0322  extracellular solute-binding protein family 1  41.71 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4198  extracellular solute-binding protein family 1  38.65 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.06 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 406 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 503 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.1 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.49 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.65 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.43 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.9 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.72 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 429 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.03 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  31.94 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  29.33 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  28.48 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  43.64 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  21.1 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1043  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.07 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.04 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  28.14 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 970 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  26.61 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0496  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.44 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.9 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.62 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>