157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1046 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1046  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 446 aa  925    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1595  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.780174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1585  extracellular solute-binding protein family 1  30.82 
 
 		 442 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2265  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000515551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.3 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0181  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000497192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 447 aa  67  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  31.12 
 
 		 421 aa  67  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  27.81 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.14 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.89 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.79 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.66 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1111  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.689899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.72 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.72 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.59 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.59 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.33 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.33 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.06 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.5 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  23.3 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0175  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>