66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3240 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 522 aa  1075    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3570  hypothetical protein  24.41 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 585 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.02 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.58 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  20.47 
 
 		 567 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.97 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.1 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  20.77 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.47 
 
 		 557 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.89 
 
 		 421 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 542 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  20.73 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  19.82 
 
 		 549 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 500 aa  48.9  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  22.94 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 536 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.71 
 
 		 239 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  21.43 
 
 		 557 aa  47.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.53 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  23.19 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.14 
 
 		 569 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 433 aa  44.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 573 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  21.58 
 
 		 551 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>