22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0597 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
500 aa  1016    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
482 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
506 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  35.05 
 
 
467 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  34.84 
 
 
467 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 
477 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  34.93 
 
 
467 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  34.57 
 
 
483 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
523 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
518 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
501 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
518 aa  143  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 
514 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
566 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
525 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.01 
 
 
503 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
522 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  21.18 
 
 
565 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
450 aa  47  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>