19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0147 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 490 aa  995    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  49.03 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  31.65 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  31.43 
 
 		 467 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 506 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  31.65 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 518 aa  143  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  33.03 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  26.64 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  20.11 
 
 		 522 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  32.17 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>