21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1708 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 518 aa  1066    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 482 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  34.43 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  34.43 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 477 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  30.82 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  30.78 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  28.75 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 514 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.32 
 
 		 503 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 537 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>