30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1077 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 477 aa  967    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  72.96 
 
 		 467 aa  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  67.01 
 
 		 483 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  72.96 
 
 		 467 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  57.08 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  49.01 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  33.06 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 523 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 		 490 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 		 501 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 518 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 		 518 aa  202  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 522 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  21.1 
 
 		 556 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 456 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.6 
 
 		 559 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 537 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 573 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 497 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>