17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0146 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 518 aa  1055    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  52.56 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  29.32 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  29.32 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  30.59 
 
 		 483 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 477 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 506 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  28.7 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 500 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 518 aa  133  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 525 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  36.08 
 
 		 434 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>