25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1466 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  81.41 
 
 		 467 aa  792    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  100 
 
 		 483 aa  986    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  80.98 
 
 		 467 aa  791    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  67.22 
 
 		 477 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  55.79 
 
 		 482 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  46.53 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  48.76 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 523 aa  227  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 501 aa  222  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 490 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 		 518 aa  203  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 518 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 505 aa  57  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 573 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 522 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  20.43 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.5 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 457 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>