45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1717 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 501 aa  1034    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  31.79 
 
 		 467 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  31.35 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  31.54 
 
 		 483 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  31.85 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 506 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 518 aa  172  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 523 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  21.96 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 559 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.05 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  24.62 
 
 		 558 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  21.41 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.21 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.42 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.64 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3570  hypothetical protein  21.32 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.08 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 573 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  22.43 
 
 		 568 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>