37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1155    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  67.61 
 
 		 567 aa  787    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.98 
 
 		 544 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  28.82 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 563 aa  173  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.88 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 552 aa  170  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  29.42 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.43 
 
 		 552 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  28.02 
 
 		 552 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  26.51 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  25.65 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.96 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.61 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.25 
 
 		 503 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 523 aa  57  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  27.31 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  23.35 
 
 		 553 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  25.34 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 399 aa  52  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.2 
 
 		 435 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  29.79 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 552 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 436 aa  43.5  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>