33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0130 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 561 aa  1146    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  37.15 
 
 		 544 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  33.39 
 
 		 563 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 547 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  28.6 
 
 		 552 aa  190  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.72 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  27.74 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.81 
 
 		 547 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 552 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  27.89 
 
 		 558 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.27 
 
 		 564 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  26.49 
 
 		 560 aa  130  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 565 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.69 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  24.91 
 
 		 568 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  25.52 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  21.27 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 537 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 544 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.65 
 
 		 503 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  21.06 
 
 		 510 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.56 
 
 		 520 aa  47.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  21.18 
 
 		 553 aa  47.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  30.4 
 
 		 408 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 556 aa  44.3  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>