38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1437 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 544 aa  1102    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  38.04 
 
 		 547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  31.79 
 
 		 563 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.38 
 
 		 544 aa  219  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  32.73 
 
 		 552 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 		 561 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 		 537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  29.45 
 
 		 557 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 561 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.47 
 
 		 547 aa  193  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  29.98 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.88 
 
 		 552 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.99 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 548 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 565 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  27.48 
 
 		 558 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.25 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  26.61 
 
 		 560 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  27.85 
 
 		 568 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  28.25 
 
 		 567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  37.21 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 447 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  20.99 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  21.12 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  33.33 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.35 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25.71 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.91 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 463 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 463 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>