66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  59.34 
 
 		 553 aa  683    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  100 
 
 		 551 aa  1117    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  62.09 
 
 		 542 aa  688    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  52.67 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  52.89 
 
 		 552 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  51.37 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  53.71 
 
 		 552 aa  541  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  44.95 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  44.1 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.6 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  44.75 
 
 		 559 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.21 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  36.86 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  33.45 
 
 		 586 aa  300  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 567 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.04 
 
 		 511 aa  83.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 536 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  26.24 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 520 aa  73.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.05 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.06 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.04 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.28 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.17 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.8 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 		 486 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.05 
 
 		 552 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 537 aa  53.9  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  25.13 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 509 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  23.75 
 
 		 567 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.32 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 585 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.32 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 428 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 443 aa  43.9  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 522 aa  43.9  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 438 aa  43.9  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 414 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>