53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3323 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  71.84 
 
 		 552 aa  789    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 552 aa  1120    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  52.15 
 
 		 553 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  53.77 
 
 		 551 aa  547  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  48.29 
 
 		 553 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  47.23 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  46.57 
 
 		 542 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  41.11 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  42.55 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  40.04 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  39.39 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.75 
 
 		 559 aa  346  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.57 
 
 		 557 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  28.55 
 
 		 586 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 541 aa  206  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 567 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.49 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  25 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 458 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 486 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.62 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 556 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.67 
 
 		 537 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  20.96 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 459 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 450 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 587 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  21.25 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.09 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>