86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0279 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 510 aa  1040    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 567 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 437 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.42 
 
 		 437 aa  123  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.42 
 
 		 437 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 509 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 428 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 486 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.55 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 571 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  25.34 
 
 		 551 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.67 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  32.1 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  33.54 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.96 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.03 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.72 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  20.23 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.29 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.97 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  23.97 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.35 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  21.38 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  20.73 
 
 		 556 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.7 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 465 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  19.23 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 548 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  21.77 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  20.06 
 
 		 568 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.72 
 
 		 557 aa  51.6  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 552 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.25 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.9 
 
 		 544 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  18.98 
 
 		 564 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.52 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  22.03 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 447 aa  44.3  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 431 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>