67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0931 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 544 aa  1117    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 559 aa  120  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 567 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 536 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 		 510 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 542 aa  87  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 571 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.95 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.61 
 
 		 527 aa  76.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  22.74 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  22.36 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.11 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 553 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.53 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  34.59 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.61 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  22.31 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  20.87 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 452 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.52 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.27 
 
 		 425 aa  49.7  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 533 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  22.12 
 
 		 557 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 462 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.22 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.22 
 
 		 437 aa  47.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  21.65 
 
 		 558 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.21 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 421 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.46 
 
 		 511 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.8 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.24 
 
 		 441 aa  43.5  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>