224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0482 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 443 aa  901    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  84.65 
 
 		 441 aa  775    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  39.77 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  39.77 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  39.77 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  38.99 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  39.65 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  39.75 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.86 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  34.25 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  25.19 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.03 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 544 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  23.98 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.3 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.3 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.19 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  41.67 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  24.53 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  25.79 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.95 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.92 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.69 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.63 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  25.76 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.51 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 445 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.04 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.72 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.58 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.45 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 961 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.89 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  26.67 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  20.36 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.84 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.23 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>