41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2335 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 482 aa  987    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  58.97 
 
 		 467 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  59.19 
 
 		 467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  57.08 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  55.58 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  53.62 
 
 		 467 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  36.8 
 
 		 500 aa  286  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 501 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0147  extracellular solute-binding protein family 1  34.41 
 
 		 490 aa  237  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  32.39 
 
 		 518 aa  224  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 518 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 573 aa  57  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  20.58 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  22.18 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.82 
 
 		 559 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  21.56 
 
 		 558 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.78 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  24.19 
 
 		 558 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 585 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 549 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 532 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  20.62 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.35 
 
 		 552 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  23.59 
 
 		 557 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>