59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0395 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1150    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 558 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.18 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 505 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  32.95 
 
 		 551 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 544 aa  120  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.66 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 486 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 533 aa  104  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 541 aa  97.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.23 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  24.01 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.44 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  22.88 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.92 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.94 
 
 		 551 aa  67  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.01 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 567 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.36 
 
 		 239 aa  57  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 556 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 503 aa  50.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 366 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 		 429 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 420 aa  44.3  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>