65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0150 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
567 aa  1172    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  41.47 
 
 
573 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  39.37 
 
 
569 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  34.3 
 
 
556 aa  293  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 
548 aa  276  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 
565 aa  210  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 
558 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
505 aa  85.9  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.24 
 
 
556 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
536 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 
568 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 
553 aa  69.3  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.93 
 
 
559 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  19.6 
 
 
551 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 
557 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  23.23 
 
 
551 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.11 
 
 
520 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  22.15 
 
 
553 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
523 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 
527 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.65 
 
 
544 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1549  hypothetical protein  23.14 
 
 
595 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0768704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
588 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
480 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 
553 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
457 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 
533 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
420 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 
571 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 
525 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 
558 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
557 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  20.73 
 
 
533 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  18.87 
 
 
510 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
556 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  27.92 
 
 
467 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.79 
 
 
239 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 
542 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.32 
 
 
537 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 
552 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 
523 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 
477 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  27.27 
 
 
467 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
440 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
482 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
467 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
419 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  19.79 
 
 
514 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
413 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0087  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
175 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000254979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
459 aa  43.9  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>