60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  60.27 
 
 		 559 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 557 aa  1135    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  58.18 
 
 		 556 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  39.64 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  39.27 
 
 		 551 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  37.97 
 
 		 542 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  38.52 
 
 		 552 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  35.89 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  37.57 
 
 		 552 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  32.62 
 
 		 553 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.15 
 
 		 544 aa  317  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  36.35 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  31.75 
 
 		 557 aa  253  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  28.68 
 
 		 586 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 527 aa  91.3  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 567 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  19.96 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  23.94 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.55 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.55 
 
 		 520 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.59 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 573 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 486 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 525 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 558 aa  53.5  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 585 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  20.87 
 
 		 556 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 444 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 		 427 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 567 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 450 aa  50.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.91 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 454 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.18 
 
 		 511 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.54 
 
 		 422 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.54 
 
 		 422 aa  47.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 530 aa  47.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 537 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4092  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 445 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518601  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.33 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  32.71 
 
 		 442 aa  43.9  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>