79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2806 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 556 aa  1136    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  67.32 
 
 		 559 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  58.98 
 
 		 557 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  44.26 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  41.22 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  40.29 
 
 		 542 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  41.28 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  41.17 
 
 		 553 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  39.51 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  39.93 
 
 		 556 aa  343  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.79 
 
 		 544 aa  317  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  35.51 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  28.24 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  30.12 
 
 		 557 aa  223  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 567 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 505 aa  88.6  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 544 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 523 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 566 aa  70.1  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.82 
 
 		 520 aa  67  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.2 
 
 		 527 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.88 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  20.77 
 
 		 510 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.08 
 
 		 422 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.08 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 422 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 533 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 537 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.57 
 
 		 453 aa  50.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.38 
 
 		 556 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 434 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 425 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.48 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 998 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 421 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3570  hypothetical protein  20.96 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.41 
 
 		 537 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 571 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.01 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 465 aa  44.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 445 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  21.47 
 
 		 551 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  20.9 
 
 		 405 aa  43.5  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>