56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1016 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 585 aa  1205    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 536 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.34 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.48 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 559 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 505 aa  124  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 527 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 558 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 		 533 aa  91.3  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 486 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 567 aa  87  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  26.84 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 566 aa  80.1  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  22.2 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.94 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  32.1 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.27 
 
 		 559 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 552 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.63 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 567 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 556 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 523 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  27.78 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 523 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 451 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 588 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 552 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  24.13 
 
 		 551 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.84 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  23.26 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 482 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 458 aa  43.9  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>