93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1101 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
567 aa  1172    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 
510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.46 
 
 
553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
509 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  24.33 
 
 
551 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
542 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
571 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
530 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 
556 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 
541 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
553 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
452 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 
428 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.53 
 
 
437 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.53 
 
 
437 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
437 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 
443 aa  87.8  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  31.94 
 
 
549 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
585 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 
559 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
537 aa  82  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.96 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.24 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
522 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
533 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 
552 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.67 
 
 
520 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.94 
 
 
544 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1549  hypothetical protein  22.16 
 
 
595 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0768704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
559 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 
561 aa  63.9  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  20.5 
 
 
522 aa  63.9  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.35 
 
 
552 aa  63.5  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  28.68 
 
 
551 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 
531 aa  60.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 
556 aa  58.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
442 aa  57.4  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.65 
 
 
544 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.57 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1095  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 
530 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.24 
 
 
564 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  25.23 
 
 
567 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.37 
 
 
537 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.36 
 
 
425 aa  54.3  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
432 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
417 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.53 
 
 
420 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  23.32 
 
 
557 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
536 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 
434 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
420 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
422 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
453 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
525 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 
444 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 
557 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.34 
 
 
443 aa  47.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 
429 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
454 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  39.68 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
447 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  18.92 
 
 
537 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  20.48 
 
 
552 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
418 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
418 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
419 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 
587 aa  45.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.41 
 
 
421 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  21.7 
 
 
552 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
421 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
420 aa  43.9  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.03 
 
 
544 aa  43.9  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1068  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
429 aa  43.9  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.501776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
424 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>