58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2998 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 552 aa  1125    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  70.89 
 
 		 552 aa  789    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  53.67 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  54.1 
 
 		 551 aa  571  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  48.82 
 
 		 553 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  47.03 
 
 		 542 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  46.4 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  44.55 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.11 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  42.18 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.58 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  39.36 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.45 
 
 		 557 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  30.68 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 541 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 567 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.28 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 548 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 510 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.1 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  23.48 
 
 		 551 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 537 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 450 aa  53.9  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 		 552 aa  53.9  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 458 aa  53.5  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  21.13 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.56 
 
 		 527 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 558 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 565 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 573 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.08 
 
 		 503 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 424 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 510 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 509 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 585 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 445 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 561 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.07 
 
 		 526 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.37 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 430 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  24.09 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.78 
 
 		 544 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>