54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3388 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 547 aa  1103    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  37.52 
 
 		 544 aa  297  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  30.52 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 537 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  28.99 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 563 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.29 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.96 
 
 		 547 aa  197  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  27.29 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  28.37 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 561 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 561 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  27.45 
 
 		 560 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.22 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.75 
 
 		 552 aa  160  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  28.85 
 
 		 567 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  28.15 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.45 
 
 		 544 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  20.96 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.28 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.84 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 522 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 443 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  23.53 
 
 		 553 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 510 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  27.94 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 404 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 542 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 426 aa  47  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 429 aa  47  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 571 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  19.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 366 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  30.77 
 
 		 551 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  21.35 
 
 		 551 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 399 aa  44.3  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 		 435 aa  43.9  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.52 
 
 		 427 aa  43.9  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>