59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1609 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  59.27 
 
 		 552 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 557 aa  1141    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  51.35 
 
 		 564 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  41.97 
 
 		 561 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  41.61 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.88 
 
 		 552 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  39.89 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  38.87 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  40.36 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  38.07 
 
 		 548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  34.64 
 
 		 565 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  35.96 
 
 		 558 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.86 
 
 		 544 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  27.96 
 
 		 552 aa  183  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  28.7 
 
 		 568 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.43 
 
 		 547 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 561 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  28.05 
 
 		 567 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.02 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.88 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 567 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 412 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 421 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  29.6 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 571 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 443 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 492 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  31.73 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.71 
 
 		 430 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  25.95 
 
 		 618 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.81 
 
 		 437 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  20.96 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 434 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>