52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1293 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 564 aa  1145    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  51.71 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  47.07 
 
 		 552 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.95 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  39.68 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.85 
 
 		 552 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  37.64 
 
 		 532 aa  356  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  36.33 
 
 		 537 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  35.73 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  37.01 
 
 		 548 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  32.92 
 
 		 558 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 547 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.39 
 
 		 544 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  26.74 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.84 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  25.51 
 
 		 568 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  26.03 
 
 		 567 aa  130  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 509 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 567 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.01 
 
 		 544 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  31.94 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1013  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 494 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.984819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  20.53 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 399 aa  47.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.35 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  34.21 
 
 		 446 aa  47  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 419 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 571 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  18.97 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 420 aa  43.9  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>