77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 503 aa  1027    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.12 
 
 		 544 aa  90.1  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.74 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  24.46 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  22.34 
 
 		 568 aa  73.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  28.8 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 548 aa  67  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  23.09 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.94 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  21.35 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.84 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  19.89 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  47.54 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 536 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  20.84 
 
 		 532 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 557 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  34.69 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  22.52 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  34.69 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.22 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  22.46 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  19.65 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 559 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 552 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  25.28 
 
 		 409 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.62 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.52 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  36.25 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 501 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  22.06 
 
 		 552 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  19.07 
 
 		 564 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1283  hypothetical protein  20.05 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.205263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.16 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  20.89 
 
 		 551 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  35.48 
 
 		 531 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 518 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.2 
 
 		 559 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>