195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2094 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  84.65 
 
 
443 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
441 aa  894    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  39.07 
 
 
437 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  39.07 
 
 
437 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  39.07 
 
 
437 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  38.7 
 
 
443 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  38.5 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  39.6 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
509 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
549 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.41 
 
 
503 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
533 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.48 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
571 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
443 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
544 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.11 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
447 aa  61.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.86 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
429 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.84 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.17 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.2 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  23.88 
 
 
448 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
413 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.34 
 
 
430 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  25.52 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
423 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  42.31 
 
 
522 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.1 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.1 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 
486 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  26.76 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 
459 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.25 
 
 
537 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  29.41 
 
 
437 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
537 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
427 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
435 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 
487 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  22.11 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.52 
 
 
424 aa  53.5  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  27.89 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.21 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  31.86 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.43 
 
 
443 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  43.55 
 
 
558 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
443 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 
420 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
961 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  55 
 
 
520 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
498 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 
530 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.21 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
416 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.48 
 
 
416 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.96 
 
 
366 aa  50.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  30.52 
 
 
505 aa  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
415 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.75 
 
 
426 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
440 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
533 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>