71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 426 aa  838    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  45.19 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  37.19 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  33.15 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.62 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  20.43 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  20.05 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  19.86 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  21.09 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.17 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.2 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  20.48 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.28 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.17 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 449 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  21.25 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  19.79 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0276  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00588273  hitchhiker  0.000015311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  36.92 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  41.38 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.95 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>