110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3114 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  86.67 
 
 		 509 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 510 aa  1039    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  32.25 
 
 		 522 aa  282  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.69 
 
 		 503 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 567 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 552 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 549 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 563 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 523 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 544 aa  87.4  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  22.63 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 571 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  39.06 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  39.06 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  22.94 
 
 		 568 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  24.31 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.58 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.41 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  33.99 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.09 
 
 		 564 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.35 
 
 		 544 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  24.11 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  20.96 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.44 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  20.41 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.94 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.99 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 532 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 536 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  28.73 
 
 		 560 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 565 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 553 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.18 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 424 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 424 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 552 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 420 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 548 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 427 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.77 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.88 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.61 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.14 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.79 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.35 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  21.13 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>