101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2709 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
549 aa  1120    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  31.91 
 
 
571 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
544 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
523 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 
533 aa  97.8  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
486 aa  97.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
510 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.39 
 
 
437 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.39 
 
 
437 aa  93.2  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
437 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
510 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
509 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 
452 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  31.94 
 
 
567 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
536 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  39.66 
 
 
428 aa  87  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
537 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.46 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  27.32 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.56 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
522 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
531 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.93 
 
 
527 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
559 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
557 aa  63.9  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
533 aa  63.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
470 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.71 
 
 
544 aa  62  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
556 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 
566 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
553 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 
525 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
459 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
530 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.04 
 
 
425 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  26.42 
 
 
551 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
422 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
468 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
548 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
456 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
441 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.48 
 
 
435 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  19.82 
 
 
522 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.32 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
506 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 
406 aa  48.9  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.68 
 
 
537 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  32.77 
 
 
455 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.07 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.14 
 
 
239 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.32 
 
 
410 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
441 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
455 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.81 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.81 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 
444 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 
490 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.71 
 
 
551 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.85 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
573 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
488 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 
418 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 
426 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
424 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
441 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
421 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
441 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
431 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
482 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
442 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.56 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
433 aa  43.9  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.78 
 
 
441 aa  43.9  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 
425 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>